[建模与可视化]怎么用VMD画和以下图片中类似的偶极矩图,怎么确定正电中心和负电中心

[建模与可视化]怎么用VMD画和以下图片中类似的偶极矩图,怎么确定正电中心和负电中心

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[建模与可视化]

怎么用VMD画和以下图片中类似的偶极矩图,怎么确定正电中心和负电中心

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Gaussian算完了之后输出文件里直接读偶极矩矢量

Multiwfn载入fch文件后,主功能300的子功能5也可以算偶极矩矢量

之后用VMD的绘图命令自己绘制箭头,参考下文的脚本里牵扯的绘制命令

使用Multiwfn计算分子片段的偶极矩和复合物中单体的偶极矩

http://sobereva.com/558(http://bbs.keinsci.com/thread-18068-1-1.html)

(或者直接把整个体系作为一个片段,直接按上文的做法画图)

该写在正文里的内容别就光写在标题里

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sobereva 发表于 2025-4-16 04:34

Gaussian算完了之后输出文件里直接读偶极矩矢量

Multiwfn载入fch文件后,主功能300的子功能5也可以算偶极 ...

好的好的,感谢回复

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发表于 Post on 2025-4-16 13:21:38

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sobereva 发表于 2025-4-16 04:34

Gaussian算完了之后输出文件里直接读偶极矩矢量

Multiwfn载入fch文件后,主功能300的子功能5也可以算偶极 ...

VMD显示的偶极矩指向和高斯显示的偶极矩方向不一样,如何想和高斯里面的方向一致,应该怎么做呢

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发表于 Post on 2025-4-17 14:58:11

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木鱼 发表于 2025-4-16 13:21

VMD显示的偶极矩指向和高斯显示的偶极矩方向不一样,如何想和高斯里面的方向一致,应该怎么做呢

分清楚输入朝向和标准朝向的偶极矩,看下文了解朝向问题

谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用

http://sobereva.com/297(http://bbs.keinsci.com/thread-1355-1-1.html)

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